— карстовые. Они располагаются в карстовых воронках или в карстовых провалах и возникают в областях, сложенных растворимыми породами. В областях многолетней мерзлоты образуются термокарстовые котловины, обязанные происхождением таянию ископаемого льда и мерзлых пород, а также просадкам грунта. Многие тундровые озера являются термокарстовыми;

— прибрежные озера. Они образовались вследствие обособления части моря от остальной наносами песка или ила. Лиманов и лагун много на побережье Черного и Азовского морей;

— подпрудные озера возникают при запруживании водотока оползнями, обвалами, лавовыми потоками и ледниковой мореной. Так в 1911 году на Памире образовалось Сарезское озеро с глубиной 505 м. Река была запружена колоссальным горным обвалом. Часты подпрудные озера и в Гималаях. Многие озера Сихотэ-Алиня (Россия), озеро Севан, озеро Тана (Африка) образовались вследствие запруживания реки лавовыми потоками;

— искусственные озера — пруды и водохранилища;

— озера-старицы образовались при меандрировании русел рек.

Водная масса озер имеет преимущественно атмосферное происхождение и попадает в озеро путем выпадения осадков, конденсации атмосферной влаги на водной поверхности, при поступлении воды из рек и ручьев и за счет грунтового питания. Расход озерной воды осуществляется через испарение, речной сток и сток в грунтовые воды. В некоторых озерах современная водная масса пришла на смену морской, занимавшей котловину в недалеком геологическом прошлом. На месте современных Балтийского и Белого морей, Ладожского и Онежского озер, а также шведских озер в ледниковое время было Иольдиевое море. После его распада сформировались озера сначала с соленой морской, а затем уже с пресной водой. Такие озера называют реликтовыми или остаточными. Животные, которые там обитают, приспосабливаются к озерным условиям обитания.